闽清简称梅。唐贞元元年（公元785年）拆侯官县西乡十里设梅溪场，旋升为县，后改名梅清县。五代后梁乾化元年（911年）以梅溪与闽江汇合，江水浊溪水清，改名闽清县。历属福州、长乐府、东都、福州、福安府、福州路、福州府、闽海道。

1949年8月15日解放。1950年属闽侯专区，1956年改属南平专区，1959年复属闽侯专区（1971年闽侯专区改称莆田地区），1983年划归福州市。
　　宋时分为奉政、寿宁2乡。元明仍沿其旧。清顺治十七年（1661年）分为升平、和丰2坊和旌良、旌善、绥来、淳化、怀德5乡。民国25年（1936年）划为3个区，民国31年并为梅南区，民国35年划为梅城、玉文2镇和白台、半岭、金沙、龙峰、合龙、清溪、双芝、杉村、埘坪9乡。

1949年仍沿其旧。1958年实行人民公社化，1961年划为16个人民公社，1983年划为17个人民公社。

1984年实行政社分开，各公社分别改为乡（镇），共设3个镇14个乡，后增设云龙乡，并陆续将7个乡改镇。

2000年，撤销省璜乡，设立省璜镇。2000年底，闽清县辖梅城、东桥、雄江、梅溪、金沙、白樟、白中、坂东、池园、塔庄、省潢11个镇，下祝、桔林、云龙、三溪、后佳、佳头、上莲、7个乡，设17个居委会、271个村委会。面积1466平方千米，人口30.41万人。　根据第五次人口普查数据：总人口288598人，其中：梅城镇 35432人、梅溪镇 22416人、白樟镇 20048人、金沙镇 12948人、白中镇 18641人、池园镇 22332人、坂东镇 39293人、塔庄镇 21217人、省璜镇 17639人、雄江镇 5195人、东桥镇 18451人、云龙乡 11410人、上莲乡 7690人、佳头乡 866人、后佳乡 3329人、三溪乡 8362人、桔林乡 6339人、下祝乡 16990人。

2000年，闽清县行政区划一览表（资料截止日期： 2000年12月31日）：

2003年，闽清县辖11个镇、7个乡：梅城镇、坂东镇、池园镇、梅溪镇、白樟镇、白中镇、塔庄镇、东桥镇、雄江镇、金沙镇、省璜镇、云龙乡、上莲乡、三溪乡、下祝乡、桔林乡、后佳乡、佳头乡。

2004年7月28日，福建省人民政府（闽政文[2004]243号）批复同意撤销闽清县后佳乡、佳头乡并入上莲乡。合并后的上莲乡辖上莲、溪坪、新村、莲埔、上寨、田溪、石漏、下丰、上丰、佳头、大土乾、街中、福星、佳洋、卑溪、林中、顶洋、樟里18个村委会。上莲乡政府驻上莲村。行政区划调整后，闽清县辖11个镇、5个乡：梅城镇、坂东镇、池园镇、梅溪镇、白樟镇、白中镇、塔庄镇、东桥镇、雄江镇、金沙镇、省璜镇、云龙乡、上莲乡、三溪乡、下祝乡、桔林乡。